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毒素（Toxins），一般指人体外毒素，有别于人体自身在糖、蛋白质、脂肪代谢过程中产生的内毒素，外毒素指外在环境的环境污染带来的有害物质，如空气污染、水污染、食品污染、化学药品的毒副作用、病原微生物（细菌、病毒等）。

生物毒素（Biotoxins）是生物在生长和代谢过程中产生的有毒化学物质（Poisons），有蛋白毒素和非蛋白毒素，根据其产生的来源可分为：

植物毒素（Phytotoxins），如蓖麻毒素、相思豆毒素、蒴莲根毒素等；

细菌毒素（Bacterial toxins)，又称微生物毒素（Microbial Toxins），如白喉毒素、霍乱毒素、肉毒毒素、破伤风毒素、葡萄球菌毒素等；

动物毒素（Venom），如蛇毒、蜘蛛毒、蛙毒、蝎毒、蜂毒、蚁毒、蜈蚣毒、河豚毒素等；

霉菌毒素，又称真菌毒素（Mycotoxins），如黄曲霉素、赭曲霉素、玉米赤霉醇、麦角毒素、毒蕈毒素-蝇蕈碱、鹅膏蕈碱等。

海洋毒素（Marine Toxins），海洋生物体产生的毒素，根据毒性作用特征可分为腹泻性贝类毒素(Diarrhetic Shellfish Poisoning，DSP)、麻痹性贝类毒素(Paralytic Shellfish Poisoning，PSP)、神经性贝类毒素(Neurotoxic Shellfish Poisoning， NSP)和记忆缺损性贝类毒素(Amnesic Shellfish Poisoning， ASP)等。重要的海洋毒素有河豚毒素、石房蛤毒素、肉毒鱼毒素、沙海葵毒素、海兔毒素、鱼腥毒素、海参毒素和沙蚕毒素等，不但具有强烈的毒性，而且具有广谱的药理效应。